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破解复杂样本提取难题｜凡知医学核酸提取一站式方案

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核酸在生物生长、遗传、变异等一系列重大生命现象中起着决定性的作用，是分子生物学研究的基础。实验中提取样本种类繁多，类型广泛，如各种抗凝全血、拭子、唾液、环境样本、动植物组织、细菌、真菌、细胞、病毒、石蜡切片等。每类样本都有不同特点，核酸提取难度也不同。

本次我们整理了多种常见样本的提取特点，希望帮助大家更好地完成。

01 FFPE 样本

1. 石蜡会阻碍消化液对组织的渗透，影响组织消化和DNA/RNA释放：FFPE样本指人或者动植物组织样本利用福尔马林固定、石蜡包埋形成的石蜡切片或者石蜡块样本。福尔马林会使核酸与核酸之间，蛋白与蛋白之间，以及核酸与蛋白之间发生交联，影响提取的核酸质量，还会引起碱基脱嘌呤，破坏DNA/RNA双链的稳定性。

2. 处理过程中DNA/RNA易降解：FFPE样本浸蜡与包埋时需加热处理，导致部分DNA/RNA解链，并且残留的甲醛对解链后的DNA/RNA单链进行甲基化修饰，修饰后的DNA/RNA单链不易复性且易降解。

解决方案：

凡知医学针对FFPE提取特点，凡知医学推出以下解决试剂盒：

病毒样本

提取难点

1. 病毒核酸提取的首要挑战是从各种样本中提取高质量的核酸。样本可能来自不同的渠道，如血液、尿液等，这些样本可能含有较低的病毒载量或被其他物质污染。

2. 病毒的遗传物质通常被包裹在蛋白质外壳中，因此需要有效的方法打破这一结构，以释放核酸。

3. 提取过程需确保病毒核酸不会被降解，这通常需要避免核酸酶的污染和适当的保存条件。

解决方案

目前凡知医学可针对病毒样本提取的多种难点，提供以下解决方案：

组织/细胞样本

提取难点

组织细胞样本是常见的样本类型，其样本需要经过液氮研磨和较长时间的组织消化，方可进行DNA或RNA的提取，提取难度主要包括核酸得率低、核酸降解、试剂残留等问题。

解决方案

目前凡知医学经过不断的优化升级，研发出多款能够满足客户不同需求的相关试剂盒：

血液样本

提取难点

血液样本分为全血、血浆、血清三种，血液包含有红细胞、白细胞、血小板和血浆等多种因素，每种成分含有不同的生物化学物质，如蛋白质、糖类、脂质等，这些物质在提取核酸过程中可能干扰核酸的纯度和完整性。血液样本中不仅含有基因组DNA，还有细胞内和血浆中的游离DNA和RNA，血液的提取难度也存在差异。

解决方案

针对血液样本提取特点，凡知医学推出以下解决试剂盒：

细菌/真菌样本

提取难点

1. 细胞壁结构差异：不同微生物的细胞壁成分和厚度不同，例如革兰氏阳性菌（如金黄色葡萄球菌）具有厚厚的肽聚糖细胞壁，抗裂解能力强；真菌（如白色念珠菌）细胞壁由几丁质和葡聚糖组成，传统裂解方法难以高效破壁。

2. 抑制剂干扰：环境样本中常含有腐殖质、色素等杂质，如土壤中的腐殖质、水体中的盐分等，这些物质会干扰核酸提取纯化和后续的检测分析。

3. DNA的损伤：真菌细胞内可能含有大量的氧自由基或有毒代谢产物，这些物质可能对DNA造成氧化损伤。

解决方案

凡知医学根据此类样本的特点，推出相关提取试剂盒：

土壤/粪便样本

提取难点

土壤样本中含有大量的腐殖酸、金属离子等抑制物，其容易与核酸一起被抽提，且会影响DNA聚合酶活性，进而影响下游PCR及测序过程，干扰下游实验。粪便样本同样具有类似的复杂性，含有大量胆红素、胆盐酸等抑制因子，且不同物种的粪便存在显著差异，成分复杂且不稳定，造成粪便样本提取困难。

解决方案

凡知医学针对土壤和粪便样本gDNA纯化难题，轻松获得高质量的 gDNA，并提供以下解决方案：

植物样本

提取难点

1. 裂解难度大：植物样本中的细胞壁大大增加了裂解难度。

2. 纯化难度大：植物样本多数富含多糖多酚。多糖普遍存在于自然界植物体中，其性质与RNA相似，在提取过程中易与RNA共沉淀，难以去除，并且在沉淀RNA时，多糖往往会产生胶状沉淀，影响后续实验的酶活性。而多酚普遍存在于果实及木本植物各组织中，还原能力强，易被氧化为醌类物质，醌类物质易与RNA结合，导致RNA活性丧失。此外在提取过程中与蛋白及核酸共沉淀，形成不溶性化合物。

解决方案

针对植物样本，选择可高效清除多糖、多酚和蛋白质等杂质的试剂很关键，凡知医学特此推出植物提取试剂盒，可有效解决植物样本提取难题。