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助力微生物多样性研究——微生物基因组DNA提取解决方案!
微生物是一类肉眼不容易观察的细小生物体的总称,包括细菌、真菌、放线菌、原生动物、藻类等有细胞结构的微生物,也包括病毒、支原体、衣原体等无完整细胞结构的微生物。
它的特征可以归纳为:体积小、面积大、吸收多、转化快、生长旺、繁殖快、适应强、变异频、分布广、种类多。
DNA提取在微生物检测中扮演着不可或缺的角色。它为鉴定微生物物种、检测病原体、环境监测和食品安全等提供了基础。随着技术的进步和创新,DNA提取方法将继续提高效率和准确性,为微生物检测提供更多的应用和可能性。
获取高质量的DNA是微生物多样性研究的前提。由于微生物种类多样,细胞结构各不相同,细胞壁较厚难以裂解,以及环境样本杂质类型多,去除难度大等因素,要高效、稳定的获取高纯度的DNA存在一定的难度。
微生物基因组DNA提取难点
微生物基因组DNA提取是一个复杂的过程,涉及到许多难题。以下是一些常见的微生物提取难题和可能的解决方法:
1
样品选择
选择合适的样品对微生物进行提取是关键。有些微生物在特定环境中才能生长,因此需要进行适当的样品收集和处理。可以尝试不同的样品类型和采样方法,如土壤、水样、植物组织等,以获得更丰富的微生物群落。
2
细胞破碎
许多微生物具有复杂的细胞壁,因此细胞破碎难度较大。常规的机械破碎方法可能无法完全破坏细胞壁,导致提取效率低下。可以尝试使用生物方法(如酶解剂)或物理方法(如超声波处理)来提高细胞破碎的效果。
3
培养与非培养微生物
大部分微生物无法通过传统的培养方法而获得,因此,非培养微生物的提取变得尤为困难。为了克服培养上的障碍,科学家们正在探索多种创新方法,用于靶向或高通量测序。
4
产物纯化
微生物样品中存在多种异质性物质,如蛋白质、多糖和多种抑制性物质,会干扰基因组DNA提取的纯度和产量。目前的纯化方法主要有苯酚氯仿抽提法、离心柱法和磁珠法,每种方法各有优劣。
苯酚氯仿抽提法
苯酚氯仿提取DNA采用的是实验室常用的试剂,提取成本比较低廉。该方法的缺点是由于使用了苯酚、氯仿等试剂,毒性较大,长时间操作对人员健康有较大影响,而且核酸的回收率较低,损失量较大,不利于保护DNA,很难进行微量化的操作。
离心柱法
离心柱法DNA提取的优点是比传统的酚氯仿法提取的纯度高,有利于DNA保护,而且能进行微量操作,价格低廉。但是,离心柱法DNA提取受限于硅胶膜的承载能力,对样本起始量有一定限制。同时,离心柱法DNA提取需要反复离心,不便于高通量、自动化操作,难以满足现代生物学实验的高通量、自动化提取的要求。
磁珠法
磁珠法是纳米科技与生物技术的完美结合,具有其他DNA提取方法无法比拟的优势,主要体现在:
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能够实现自动化、高通量操作,配合全自动核酸提取仪,可实现对多个样品的处理,较传统提取方法效率翻倍。
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操作简单、用时短,整个提取流程只有裂解、结合、洗涤、洗脱四步短时间内即可完成。
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安全无毒,不使用传统方法中的苯、氯仿等有毒试剂,操作过程中接触有害化学物质的机会较少,安全性更高。
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磁珠与核酸的特异性结合使得提取的核酸纯度高、浓度大。
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可用于多种样本类型的提取,包括血液、组织、细胞、体液、土壤等,灵敏度高,适用性广。
随着当代生物学的高速发展及全自动核酸提取仪的大量普及,为了满足时代要求,凡知医学专业研制磁珠法DNA/RNA提取试剂,并开发了多系列磁珠法核酸提取的系统化方案,结合凡知医学全自动核酸提取仪,可实现一站式核酸提取,进一步提高核酸提取的效率。
微生物基因组DNA提取试剂盒
-(磁珠法)-
01
产品优势
· 过程安全:提取过程安全,不涉及有毒的酚、氯仿、β-巯基乙醇等有机溶剂。
02
案例展示
提取样本:过夜培养的沙门氏菌菌液1.5ml。由实验结果可知,凡知提取的DNA浓度和纯度均优于竞品。
03
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