助力微生物多样性研究——微生物基因组DNA提取解决方案!

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微生物是一类肉眼不容易观察的细小生物体的总称,包括细菌、真菌、放线菌、原生动物、藻类等有细胞结构的微生物,也包括病毒、支原体、衣原体等无完整细胞结构的微生物。


它的特征可以归纳为:体积小、面积大、吸收多、转化快、生长旺、繁殖快、适应强、变异频、分布广、种类多

 

DNA提取在微生物检测中扮演着不可或缺的角色。它为鉴定微生物物种、检测病原体、环境监测和食品安全等提供了基础。随着技术的进步和创新,DNA提取方法将继续提高效率和准确性,为微生物检测提供更多的应用和可能性。

 

获取高质量的DNA是微生物多样性研究的前提。由于微生物种类多样,细胞结构各不相同,细胞壁较厚难以裂解,以及环境样本杂质类型多,去除难度大等因素,要高效、稳定的获取高纯度的DNA存在一定的难度。

 

 

微生物基因组DNA提取难点

 

微生物基因组DNA提取是一个复杂的过程,涉及到许多难题。以下是一些常见的微生物提取难题和可能的解决方法:

 

1

样品选择

 

选择合适的样品对微生物进行提取是关键。有些微生物在特定环境中才能生长,因此需要进行适当的样品收集和处理。可以尝试不同的样品类型和采样方法,如土壤、水样、植物组织等,以获得更丰富的微生物群落。

 

2

细胞破碎

 

许多微生物具有复杂的细胞壁,因此细胞破碎难度较大。常规的机械破碎方法可能无法完全破坏细胞壁,导致提取效率低下。可以尝试使用生物方法(如酶解剂)或物理方法(如超声波处理)来提高细胞破碎的效果。

 

3

培养与非培养微生物

 

大部分微生物无法通过传统的培养方法而获得,因此,非培养微生物的提取变得尤为困难。为了克服培养上的障碍,科学家们正在探索多种创新方法,用于靶向或高通量测序。

4

产物纯化

 

微生物样品中存在多种异质性物质,如蛋白质、多糖和多种抑制性物质,会干扰基因组DNA提取的纯度和产量。目前的纯化方法主要有苯酚氯仿抽提法、离心柱法和磁珠法,每种方法各有优劣。

 

苯酚氯仿抽提法

苯酚氯仿提取DNA采用的是实验室常用的试剂,提取成本比较低廉。该方法的缺点是由于使用了苯酚、氯仿等试剂,毒性较大,长时间操作对人员健康有较大影响,而且核酸的回收率较低,损失量较大,不利于保护DNA,很难进行微量化的操作。

离心柱法

离心柱法DNA提取的优点是比传统的酚氯仿法提取的纯度高,有利于DNA保护,而且能进行微量操作,价格低廉。但是,离心柱法DNA提取受限于硅胶膜的承载能力,对样本起始量有一定限制。同时,离心柱法DNA提取需要反复离心,不便于高通量、自动化操作,难以满足现代生物学实验的高通量、自动化提取的要求。

 

磁珠法

磁珠法是纳米科技与生物技术的完美结合,具有其他DNA提取方法无法比拟的优势,主要体现在:

  • 能够实现自动化、高通量操作,配合全自动核酸提取仪,可实现对多个样品的处理,较传统提取方法翻倍。

  • 操作简单、用时短,整个提取流程只有裂解、结合、洗涤、洗脱四步短时间内即可完成。

  • 安全无毒,不使用传统方法中的苯、氯仿等有毒试剂,操作过程中接触有害化学物质的机会较少,安全性更高。

  • 磁珠与核酸的特异性结合使得提取的核酸纯度高、浓度大

  • 可用于多种样本类型的提取,包括血液、组织、细胞、体液、土壤等,灵敏度高,适用性广。

     

随着当代生物学的高速发展及全自动核酸提取仪的大量普及,为了满足时代要求,凡知医学专业研制磁珠法DNA/RNA提取试剂,并开发了多系列磁珠法核酸提取的系统化方案,结合凡知医学全自动核酸提取仪,可实现一站式核酸提取,进一步提高核酸提取的效率。

 

 

 

微生物基因组DNA提取试剂盒

-(磁珠法)-

 

本产品采用自主研发的磁珠纯化技术和独特的缓冲液体系,利用酶学消化的裂解方法,使核酸大量释放,提高核酸提取回收率,专注各种微生物基因组DNA的快速分离纯化。适用于多种分子生物学实验,包括酶切、文库构建、分子克隆、PCR、RT-PCR、高通量测序等多种下游实验。
 
 
 

01

产品优势

 

· 质量高产:提取DNA的产量高、完整性好,浓度可达100~300ng/μl。
· 场景灵活:既支持手动提取,又可高效的与液体工作站或全自动核酸提取仪配套使用,提升整体效率。

· 过程安全提取过程安全,不涉及有毒的酚、氯仿、β-巯基乙醇等有机溶剂。

 

02

案例展示

 

提取样本:过夜培养的沙门氏菌菌液1.5ml。由实验结果可知,凡知提取的DNA浓度和纯度均优于竞品。

 

 

 

03

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2024年11月22日 09:37
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