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全血DNA提取遇到问题很难搞?不妨试试调整这些方向
真核细胞高分子量DNA提取质量是影响后续实验重要因素,尤其在基因分型试验中,模板DNA高质量是后期实验结果准确重要保证,速度的快慢和操作是否简单亦为多数实验室考虑的主要因素,得到高纯完整的全血基因组DNA可用于科研、临床、PCR实验室快速分析要求。
全血DNA提取是一种常用的实验技术,旨在从人体全血样本中分离纯净的 DNA。全血DNA提取的原理主要包括以下几个步骤。
图1:全血血浆、白细胞、血小板、红细胞组分及所在位
首先,将全血样本进行离心,以分离血液中的红血细胞(RBCS)、白血细胞(WBCS)和血小板。离心后,上清液中含有RBCS和WBCS混合的细胞组分。血样各种成分中,只有白细胞含有DNA。
其次,采用红细胞裂解缓冲液,使RBCS在牺牲细胞膜完整性的同时释放出细胞内的血红素。血红素会结合到缓冲液中的成分上,从而不会对后续DNA提取步骤产生干扰。
然后,WBCS的核酸膜被洗涤和蛋白酶降解,以去除表面的蛋白质和杂质。随后,用组织裂解缓冲液处理细胞,以破坏细胞膜结构,释放出细胞内的DNA,此时液体中包含DNA、大量蛋白、RNA、盐类、微量血红素。
图2:提取液中的DNA、大量蛋白、RNA、盐类、微量血红素
使用3种常用方法提取各保存时长的全血标本,比较DNA的浓度和纯度,探讨3种方法的适应范围,为实验室DNA提取方法的选择提供参考。
全自动磁珠法、手工离心柱法和异丙醇沉淀法。
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DNA浓度的均值:异丙醇沉淀法优于自动磁珠法优于手工离心柱法。
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DNA浓度的稳定性:全自动磁珠法优于手工离心柱法优于手工沉淀法。
3种方法提取的DNA纯度均符合分子生物学标准要求。
4.安全无毒:不含酚、氯仿等有毒化学试剂。
DNA质量是进行下一步实验的关键,DNA提取有两个基本原则:保证DNA结构的纯度和完整性。
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A260/280 >2.1 RNA污染; -
A260/280 一般在1.8-2.1,DNA提纯效果好; -
A260/280 <1.8 盐、无机物污染; -
A260/230 >2.0 DNA提纯效果较好; -
A260/230 <2.0 存在盐离子、多肽、碳水化合物等污染。
根据实验需要提取的DNA样品应作分装处理,近期实验用少量DNA样品冻存于20℃冰箱中,其余样品冻存于-80℃低温冰箱;DNA样品切忌反复冻融,若DNA样品长期存放于-20℃环境或实验过程中反复多次冻融,则易发生降解,从而造成PCR扩增后产物在电泳时产生涂抹条带或者没有条带,或阳性检出率降低等结果。
提取DNA的全血需用EDTA抗凝,保存的用量为2mL或以上,运输过程中应避免采血管反复颠倒和(或)强力震荡等,以免发生溶血;取回的全血4℃保存待用,一般存放时间不宜超过24h,以免影响DNA的提取;如需长期保存,可将其保存于-80℃低温冰箱中(经低温保存后的全血提取DNA需要较长的操作时间)全血在保存过程中应避免反复冻融。
DNA提取过程中,操作人员需穿戴实验服、口罩和手套,实验所需枪头、EP管等实验耗材需经高压灭菌消毒,并提前预热水浴锅和恒温箱。
血清分离时,操作人员动作要缓慢,操作时尽可能抽净上层血清,保留中间层的白细胞和下层的红细胞,初学者操作时不可过分追求吸净上层血清,以免将中间的白细胞层吸走而影响DNA提取。
在实验操作过程中,使用移液器吸取试剂时不要把移液器枪头伸入液体过多,以刚刚没入液面为宜,保证能吸到液体即可,避免造成浪费。PCR实验精度较高,加入试剂量多为微升计,如移液器枪头伸入试剂过多,粘附于枪头的试剂就会较多,会导致实验试剂的极大浪费。
全血DNA提取试剂盒(磁珠法)
本产品采用自主研发的磁珠纯化技术和独特的缓冲液系统,适用于从抗凝血液、浓缩血液、白膜层等生物样品中提取基因组DNA,为从人类以及哺乳动物的血液提取基因组DNA提供了一种简单、快速、高效的方法。
适用于多种分子生物学实验,包括酶切、文库构建、Southern杂交、分子克隆、PCR、RT-PCR、 芯片检测、高通量测序等下游实验。
高通量:可高效的与液体工作站或全自动核酸提取仪配套使用,提升整体效率。
参考资料:
[1]陈丽霞,张振昶,谢小冬,等.3种提取全血基因组DNA的方法比较[J].基因组学与应用生物学,2014,33(05):1110-1113.DOI:10.13417/j.gab.033.001110.
[2]尹相林,展秀君,沈萍,等.人外周血DNA提取方法比较[J].黑龙江医药科学,2014,37(06):47-48.
[3]王秀娟,肖瑞,张传领,等.血液基因组DNA提取试剂盒提取条件的优化[J].疾病监测与控制,2015,9(12):855-857.
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