从癌症到产检:一文读懂游离DNA(cfDNA)的医学价值

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cfDNA
 
 

游离DNA(cfDNA)是存在于人体细胞外液中的DNA片段,在生理或病理条件下(如妊娠、肿瘤等),cfDNA的含量变化和分子特征等使其成为疾病诊疗的生物标志物之一。随着cfDNA富集技术以及测序、质谱等检测技术的发展,cfDNA的检测已形成完整的检验流程。基于cfDNA检测的液体活检技术在临床肿瘤诊疗、产前检查中已得到广泛应用,并且在自身免疫病诊疗中展现出较大的潜力,是精准医疗和液体活检领域的重要方向之一。

 
 

 

cfDNA有哪些应用?
 

 

 

cfDNA的主要应用之一是在无创产前检测(NIPT)领域。cfDNA的另一个应用是癌症的检测和监测除了用于NIPT和癌症的诊断以及监测外,cfDNA还因其在其他疾病(例如心脏病发作、中风和自身免疫性疾病)的诊断和监测方面具有潜在的用途而被研究。

 

 
1.无创产前检测 
 
 
 

 

 

 

无创产前检测(NIPT)通常使用于孕期在12~24周收集的母亲血液样本。实验室从中提取cfDNA,并采用高通量测序(NGS)技术分析胎儿来源的 cfDNA。检测结果通常在 2 周内出具,以风险评分形式提示胎儿发生特定染色体异常的可能性。

 

👉用于NIPT检测的一些遗传特征包括:

 

  • 染色体非整倍体指染色体数目异常,如三体(额外染色体)或单体(缺失染色体)。常见检测对象包括:

    • 唐氏综合征(21-三体)

    • 爱德华兹综合征(18-三体)

    • 帕陶综合征(13-三体)

  • 染色体结构异常指染色体结构或排列异常,如缺失(片段丢失)或易位(片段异常连接)。

  • 单基因疾病由单个基因突变引起的遗传病,例如囊性纤维化、镰状细胞性贫血等。

     

💥NIPT是一种筛查检测,而不是诊断,仅表明染色体异常的风险高低。

 

 
2.肿瘤检测
 
 
 

 

循环肿瘤DNA(ctDNA)是游离DNA(cfDNA)的一小部分,由癌细胞释放到血液中的小DNA片段组成,在癌症研究与诊断中具有重要价值。

 

👉ctDNA 的一些特征包括:

 

  • 片段更小因存在断裂与突变,ctDNA片段通常短于正常cfDNA。

  • 携带突变信息特定突变可提示癌症类型与特征。

  • 稳定性较高在血液中可较长时间被检测到。

  • 浓度与肿瘤负荷相关随癌症分期和大小而变化。

  • 异质性强包含多种突变,增加检测分析难度。

  • 半衰期短建议采样后24小时内完成检测。

     

检测流程采集患者血液 → 提取ctDNA → 通过PCR等技术扩增 → 测序分析遗传异常。
 

结果解读通常出具风险评分,提示癌症可能性;若结果为阳性,需进一步诊断确认。

 

此外,ctDNA的分析还可用于监测对治疗的反应并检测治疗后癌症的复发。通过分析ctDNA随时间的变化,可以跟踪癌症的进展并确定治疗的有效性。

 

 
3.其他疾病的检测
 
 
 

 

除无创产前检测(NIPT)和肿瘤检测与动态监测外,游离DNA(cfDNA)在多种疾病的诊断与预后评估中展现出广阔的临床应用前景:

 

  • 心脏病发作cfDNA分析被探索作为术后急性心肌梗死(心脏病发作)诊断与预测的潜在工具。

  • 中风血液中的cfDNA可作为中风患者脑损伤的生物标志物,其分析有助于中风的诊断与预后评估。

  • 自身免疫性疾病cfDNA分析在类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病的诊断与监测方面具有应用潜力。

  • 器官移植cfDNA分析被用于监测器官移植后的状态,有助于早期发现排斥反应。

  • 妊娠并发症cfDNA分析可用于早产、先兆子痫等妊娠期并发症的诊断与监测。

 

 
cfDNA多以DNA和蛋白质结合的复合物形式存在,仅极少数为游离的DNA片段。正常情况下cfDNA在体液中的丰度低,有效获取血液中微量的cfDNA是目前cfDNA分析的主要障碍。目前,磁珠法是应用最广泛的cfDNA提取方法,其特异性吸附属性,可针对血清、血浆样本中短片段游离DNA进行定向富集,具有纯度高、回收率高、自动化程度高的优势,可适配自动化提取仪进行自动化提取、提取产量高等特点受到大家的喜爱。
 

 

凡知医学
 
 
 
血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)
 

 

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血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)

货号:FG1102

规格:48次/盒(4mL血浆)/96次/盒(2mL血浆)

 

本产品采用自主研发的磁珠纯化技术和独特的缓冲液系统,针对血清、血浆样本中短片段游离DNA进行定向富集,旨在为用户提供安全、便捷,高灵敏、高质量的核酸提取方法。

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产品优势
 
  • 起始量灵活:支持从1mL到10mL样本中提取cfDNA。
  • 产物纯度高:脂类、盐类、糖类、蛋白质等杂质残留较少,纯度高。
  • 过程安全:不涉及有毒的酚、氯仿、β-巯基乙醇等有机溶剂。
  • 应用多元化:既可支持手动提取,又可高效地与液体工作站或全自动核酸提取仪配套使用,以进行快速、大样本量的提取,提升整体效率。
  • 适用样本广:可适用于EDTA管收集的样本,也适用于各类cfDNA专用采血管收集的样本。
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实测数据展示
 

 

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提取质量数据展示
 
 
 

对cfDNA样本的质控主要是评估提取得到的cfDNA的质量、浓度及纯度,有无基因组DNA的污染以及cfDNA样本的单核小体、双核小体和三核小体的分布等。使用cfDNA样本做NGS基因检测时,需要对多个环节进行质控以确保检测结果的可靠性。

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人血浆提取浓度及片段分析示意图

凡知采用了控制变量法,针对1mL人血浆,分别选用凡知血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)和竞品在洗脱体积30μL的条件下,结果显示:凡知提取cfDNA浓度高于竞品,并且在多次重复对比实验中,显示凡知提取cfDNA浓度均高于竞品。

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猪血浆提取浓度及片段分析示意

我们选取猪血浆样本0.5mL,同时选用磁珠法试剂盒,在相同条件下分别使用凡知血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)和国内竞品,结果显示:凡知血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)A260/280范围在1.8-2.0之间,浓度高于竞品,总体提取质量优于竞品。
 
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客户使用效果反馈
 
 
 

 

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凡知与竞品cfDNA提取总量对比

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4200质控(B1-F1竞品、G1-C2凡知)

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竞品结果示意图

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凡知结果示意图
 
上述结果表明,两种试剂提取cfDNA均无大片段污染。
 
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凡知与竞品测序结果展示

上述结果表明,测序结果表明,目标区域捕获效率、去重后深度等指标,凡知试剂产品性能优于竞品。

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凡知与竞品甲基化检测结果展示

 

上述甲基化检测结果表明,相比竞品,凡知试剂提取出的cfDNA在下游目标区域甲基化均值、内参值的稳定性和一致性方面表现出优势,表明该试剂提取的DNA在浓度和纯度等方面具有更高的稳定性和可靠性。

 
 
结 语
 
 

血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)支持从1mL到10mL样本中提取cfDNA,实验操作简便,既可支持手动提取,又可高效地与液体工作站或全自动核酸提取仪配套使用,以进行快速、大样本量的提取,提升整体效率。

 
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2026年5月29日 10:54
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