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从癌症到产检:一文读懂游离DNA(cfDNA)的医学价值
游离DNA(cfDNA)是存在于人体细胞外液中的DNA片段,在生理或病理条件下(如妊娠、肿瘤等),cfDNA的含量变化和分子特征等使其成为疾病诊疗的生物标志物之一。随着cfDNA富集技术以及测序、质谱等检测技术的发展,cfDNA的检测已形成完整的检验流程。基于cfDNA检测的液体活检技术在临床肿瘤诊疗、产前检查中已得到广泛应用,并且在自身免疫病诊疗中展现出较大的潜力,是精准医疗和液体活检领域的重要方向之一。


cfDNA的主要应用之一是在无创产前检测(NIPT)领域。cfDNA的另一个应用是癌症的检测和监测。除了用于NIPT和癌症的诊断以及监测外,cfDNA还因其在其他疾病(例如心脏病发作、中风和自身免疫性疾病)的诊断和监测方面具有潜在的用途而被研究。

无创产前检测(NIPT)通常使用于孕期在12~24周收集的母亲血液样本。实验室从中提取cfDNA,并采用高通量测序(NGS)技术分析胎儿来源的 cfDNA。检测结果通常在 2 周内出具,以风险评分形式提示胎儿发生特定染色体异常的可能性。
👉用于NIPT检测的一些遗传特征包括:
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染色体非整倍体:指染色体数目异常,如三体(额外染色体)或单体(缺失染色体)。常见检测对象包括:
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唐氏综合征(21-三体)
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爱德华兹综合征(18-三体)
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帕陶综合征(13-三体)
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染色体结构异常:指染色体结构或排列异常,如缺失(片段丢失)或易位(片段异常连接)。
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单基因疾病:由单个基因突变引起的遗传病,例如囊性纤维化、镰状细胞性贫血等。
💥NIPT是一种筛查检测,而不是诊断,仅表明染色体异常的风险高低。

循环肿瘤DNA(ctDNA)是游离DNA(cfDNA)的一小部分,由癌细胞释放到血液中的小DNA片段组成,在癌症研究与诊断中具有重要价值。
👉ctDNA 的一些特征包括:
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片段更小:因存在断裂与突变,ctDNA片段通常短于正常cfDNA。
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携带突变信息:特定突变可提示癌症类型与特征。
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稳定性较高:在血液中可较长时间被检测到。
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浓度与肿瘤负荷相关:随癌症分期和大小而变化。
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异质性强:包含多种突变,增加检测分析难度。
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半衰期短:建议采样后24小时内完成检测。
检测流程:采集患者血液 → 提取ctDNA → 通过PCR等技术扩增 → 测序分析遗传异常。
结果解读:通常出具风险评分,提示癌症可能性;若结果为阳性,需进一步诊断确认。
此外,ctDNA的分析还可用于监测对治疗的反应并检测治疗后癌症的复发。通过分析ctDNA随时间的变化,可以跟踪癌症的进展并确定治疗的有效性。

除无创产前检测(NIPT)和肿瘤检测与动态监测外,游离DNA(cfDNA)在多种疾病的诊断与预后评估中展现出广阔的临床应用前景:
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心脏病发作:cfDNA分析被探索作为术后急性心肌梗死(心脏病发作)诊断与预测的潜在工具。
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中风:血液中的cfDNA可作为中风患者脑损伤的生物标志物,其分析有助于中风的诊断与预后评估。
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自身免疫性疾病:cfDNA分析在类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病的诊断与监测方面具有应用潜力。
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器官移植:cfDNA分析被用于监测器官移植后的状态,有助于早期发现排斥反应。
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妊娠并发症:cfDNA分析可用于早产、先兆子痫等妊娠期并发症的诊断与监测。


血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)
货号:FG1102
规格:48次/盒(4mL血浆)/96次/盒(2mL血浆)
本产品采用自主研发的磁珠纯化技术和独特的缓冲液系统,针对血清、血浆样本中短片段游离DNA进行定向富集,旨在为用户提供安全、便捷,高灵敏、高质量的核酸提取方法。

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起始量灵活:支持从1mL到10mL样本中提取cfDNA。 -
产物纯度高:脂类、盐类、糖类、蛋白质等杂质残留较少,纯度高。 -
过程安全:不涉及有毒的酚、氯仿、β-巯基乙醇等有机溶剂。 -
应用多元化:既可支持手动提取,又可高效地与液体工作站或全自动核酸提取仪配套使用,以进行快速、大样本量的提取,提升整体效率。 -
适用样本广:可适用于EDTA管收集的样本,也适用于各类cfDNA专用采血管收集的样本。

对cfDNA样本的质控主要是评估提取得到的cfDNA的质量、浓度及纯度,有无基因组DNA的污染以及cfDNA样本的单核小体、双核小体和三核小体的分布等。使用cfDNA样本做NGS基因检测时,需要对多个环节进行质控以确保检测结果的可靠性。

人血浆提取浓度及片段分析示意图
凡知采用了控制变量法,针对1mL人血浆,分别选用凡知血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)和竞品在洗脱体积30μL的条件下,结果显示:凡知提取cfDNA浓度高于竞品,并且在多次重复对比实验中,显示凡知提取cfDNA浓度均高于竞品。

猪血浆提取浓度及片段分析示意图

凡知与竞品cfDNA提取总量对比

4200质控(B1-F1竞品、G1-C2凡知)

竞品结果示意图


凡知与竞品测序结果展示
上述结果表明,测序结果表明,目标区域捕获效率、去重后深度等指标,凡知试剂产品性能优于竞品。

凡知与竞品甲基化检测结果展示
上述甲基化检测结果表明,相比竞品,凡知试剂提取出的cfDNA在下游目标区域甲基化均值、内参值的稳定性和一致性方面表现出优势,表明该试剂提取的DNA在浓度和纯度等方面具有更高的稳定性和可靠性。
血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)支持从1mL到10mL样本中提取cfDNA,实验操作简便,既可支持手动提取,又可高效地与液体工作站或全自动核酸提取仪配套使用,以进行快速、大样本量的提取,提升整体效率。






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